課程資訊
課程名稱
生物資訊學導論
Introduction to Bioinformatics 
開課學期
101-2 
授課對象
生物資源暨農學院  作物科學組  
授課教師
劉力瑜 
課號
Agron5050 
課程識別碼
621 U6390 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期四5,6,7(12:20~15:10) 
上課地點
 
備註
教室:農藝館316。與蔡政安、董致韡合開
總人數上限:16人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1012IntroBioinfo 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

The course will focus on the analysis and comprehension of genomic data using the open source and open development software, such as R and Bioconductor. Topics covered include: (A) Introduction, (B) Microarray data analysis, (C) Sequence analysis, and (4) Network inference. The students will be asked to make a term project and to give a final presentation. 

課程目標
Introduce current status of development of bioinformatics technologies through lecturing and paper readings. 
課程要求
Homework 40%; Final presentation 60%. 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
homework 
40% 
 
2. 
final presentation 
60% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/21  Basic statistical concepts (蔡政安) 
第2週
2/28  ---和平紀念日(放假日) 
第3週
3/7  Genetics and genomics (董致韡) 
第4週
3/14  microarray introduction and preprocessing (蔡政安) 
第5週
3/21  Identifying gene signatures (蔡政安) 
第6週
3/28  class discovery (蔡政安) 
第7週
4/4  ---溫書假(放假日) 
第8週
4/11  class prediction (蔡政安) 
第9週
4/18  DNA Sequencing (劉力瑜) 
第10週
4/25  DNA alignment and applications (劉力瑜) 
第11週
5/2  Genome annotation (董致韡) 
第12週
5/9  Open source and open development software (董致韡) 
第13週
5/16  Phylogeny and GWAS (biological parts) (董致韡) 
第14週
5/23  Practice (董致韡) 
第15週
5/30  Phylogeny and (statistical parts) (劉力瑜) 
第16週
6/6  Molecular network and systems biology (劉力瑜) 
第17週
6/13  Practice (劉力瑜) 
第18週
6/20  <b>Final Presentation</b>